คุไน
เป็นมีดสั้นนินจาที่ใช้กันทั่วไป นำมาใช้เป็นอาวุธโดยขว้างใส่คู่ต่อสู้
ชูริเคน
หรือดาวกระจายนั่นเอง เป็นอาวุธอันตรายและใช้กันมาก ดาวกระจายจะมีสองแบบ คือ อันเล็ก ที่ใช้ขว้างได้ง่าย และอันใหญ่ ที่เรียกว่า ฟูมะชูริเคน ที่ใครโดนซัดเข้าไปทีเดียวมีสิทธิ์ถึงตาย
ฟูมะชูริเคน
ดาวกระจายยักษ์อันนี้มักเรียกว่า ดาวกระจายกังหันลม เพราะมีขนาดใหญ่กว่าดาวกระจายธรรมดามาก ความแม่นยำในการขว้างน้อย แต่พลังการทำลายสูง
เข็ม
เป็นอาวุธสังหาร ที่อันตรายไม่ใช่เล่น นินจาที่ใช้เข็มเป็นอาวุธจะต้องศึกษากายวิภาค จุดต่างๆของร่างกาย เพื่อใช้เข็มแทงไปในจุดต่างๆของศัตรู เพื่อให้ขยับไม่ได้ หรือ เพื่อให้ตายในทีเดียวก็ทำได้เช่นกัน
ดาบตัดคอ
ดาบเล่มใหญ่ยักษ์ของซาบุสะ ที่คมมาก สามารถตัดร่างคนให้ขาดครึ่งได้ในทีเดียว
หุ่นเชิด
เป็นอาวุธของ แคว้นซึนะ ผู้ที่ใช้หุ่นเชิดคือ คันคุโร่ ย่าโจ และ ซาโซริ หุ่นเชิดทั่วไปมักทำจากไม้ ผู้ควบคุมหุ่นเชิดชั้นสูงจะสามารถเรียกหุ่นออกมาใช้ได้คราวละหลายสิบตัว และหุ่นเชิดที่มีแข็งแกร่งมากที่สุด ก็คือ หุ่นเชิดที่ทำจากร่างคนตาย
คาตานะ
ดาบเดี่ยว ที่มักใช้ในกลุ่มอันบุ พวกซามูไรมักจะใช้ดาบนี้
น้ำเต้าของกาอาระ
น้ำเต้าอันใหญ่ของกาอาระที่แบกไว้ ใส่ทรายจำนวนมากไว้ข้างใน โดยกาอาระจะควบคุมทรายเป็นอาวุธ โดยที่ทรายจะดูดเลือดของศัตรูที่พ่ายแพ้ ทำให้มีวิญญาณ และสามารถสร้างเกราะกำบังให้กาอาระในยามที่เกิดอันตราย แม้ว่ากาอาระจะไม่ได้สั่ง
พัดของเทมาริ
[พัดเล่มใหญ่ยักษ์ของเทมาริ จะมีวงกลมสีม่วง 3 วง ที่เทมาริเรียกว่า ดวงจันทร์ เทมาริจะใช้พัดเล่มนี้สร้างลมพายุ และสามารถใช้ทำให้ตัวลอยไปมาได้ด้วย
สนับมือ
สนับมือเหล็ก เป็นอาวุธของอาสึม่า โดยจะมีมีดที่ปลายสนับมือทั้งสองข้าง
สัตว์/แมลง
สัตว์ต่างๆก็สามารถใช้เป็นอาวุธของนินจาได้เช่นกัน สัตว์บางชนิดต้องใช้อาหารเม็ดเพื่อเพิ่มพลัง หรือแปลงร่าง อย่าง อากามารุ สุนัขของคิบะ ก็กินอาหารเม็ดเพื่อทำให้ร่างกายเป็นสีแดง และร่างขยายขึ้น ส่วนชิโนะ ก็เลี้ยงแมลงโดยให้จักระตัวเองเป็นอาหาร หรือ การทำสัญญาเลือดกับสัตว์ยักษ์ เช่น จิไรยะและนารุโตะ กับ กามะบุนตะ , ซึนาเดะ กับทากยักษ์ , รุ่นที่ 3 กับ พญาลิงเอ็นม่า , โอโรจิมารุ กับ งูยักษ์ , ครูไก กับเต่า และ คาคาชิ กับสุนัขนินจา
พู่กัน
อาวุธของ ซาอิ นินจาจากรากของโคโนะฮะ ที่มาเข้ากลุ่มคาคาชิแทนซาสึเกะที่จากไป ซาอิ สามารถวาดรูปในแผ่นยันต์ แล้วเรียกสัตว์ในรูปออกมาใช้งานได้
ดาบซาเมะฮาดะ
ดาบปากฉลาม ตั้งชื่อตามปีศาจฉลามยักษ์ สามหางในตำนาน เป็นอาวุธของ คิซาเมะ คู่หูของอิทาจิ แห่งแสงอุษา ซึ่งเป็นดาบยักษ์ที่มักจะถูกผ้าพันเอาไว้ ดาบนี้แม้จะไม่เหมาะกับการฟันให้ขาด แต่ก็คมพอที่จะสร้างความเสียหายให้ศัตรูได้มากสุดๆ